Der Vorstand des AKEK setzt sich aus Personen zusammen, die Kommissionsmitglieder oder Geschäftsstellenmitarbeitende einer Ethik-Kommission sind. Der Vorstand wird alle 3 Jahre von den Mitgliedern auf den Mitgliederversammlungen gewählt. Die Vorstandsmitglieder setzen sich ehrenamtlich für die Belange des AKEK und seinen Mitgliedern ein.
Der aktuelle Vorstand wurde auf der Mitgliederversammlung am 14. Juni 2024 gewählt.
Das Logo des Arbeitskreises zeigt den Kentauren Chiron, den Sohn der Nymphe Philyra und des Kronos. Chiron war der Lehrer des Asklepios (Aesculapius) und galt in der Antike als mythischer Schutzpatron der Medizin.
